Jones e Trump retomaram a sua sessão a 8-8 na manhã desta quarta-feira no Crucible Theatre, com o último a parecer fora de si à medida que o jogo lhe escapava.
O galês conseguiu assumir o controlo e selou o seu lugar na final four pela primeira vez com uma quebra de classe de 106.
Jones, de 30 anos, vai enfrentar o vencedor de Ronnie O'Sullivan e Stuart Bingham, ambos empatados a 4-4 nos quartos de final.
Trump, que já ganhou cinco eventos esta época, parecia bem fora do ritmo e falhou duas bolas cruciais que colocaram Jones a um frame da vitória.
Jones obrigou-o com um século de vitória e está a preparar-se para se tornar apenas o terceiro qualificador a vencer o Campeonato do Mundo, depois de Terry Griffiths em 1979 e Shaun Murphy em 2005.
Jones chegou aos quartos de final na sua estreia no ano passado, antes de cair perante Mark Allen.
Jones derrotou Zhang Anda e Si Jiahui no caminho para despachar Trump este ano.